An Borisovs Hochzeitstag auf dem Thron berechnen die Bojaren die Früchte seiner Regierungszeit: die unterdrückte Pest, die vollendeten Kriege und die Ernten. Sie sind erstaunt darüber, wie lange Godunov ihn überreden musste, die Macht zu übernehmen, und nur die Androhung einer Exkommunikation zwang ihn dazu. Boris kehrt aus der Kathedrale zurück und beabsichtigt, Botschafter zu empfangen. Voeikov verkündet den Sieg über den sibirischen Khan. Der englische Botschafter bietet die Braut Zarewitsch Fedor an; päpstlicher Nuntius - eine Vereinbarung über die Vereinigung der Kirchen; Österreichische, litauische, schwedische und florentinische Botschafter bitten respektvoll jemanden um Hilfe mit Geld oder Truppen, der ihre Besitztümer anerkennt. Die persischen und türkischen Botschafter beschuldigen sich gegenseitig, Iberia angegriffen zu haben, der Botschafter des iberischen Königs bittet um Schutz. Der Zar gibt jedem eine angemessene Antwort, voller Würde und Stärke, und befiehlt jedem, die königlichen Kammern zu betreten („Es gibt keine Barriere zwischen dem russischen Volk und dem Zaren!“). Allein gelassen triumphiert Boris und entscheidet in Erinnerung an den Tod des Prinzen: dann den unvermeidlichen Preis für die Größe des Staates. Kurz darauf, während Boris in der Klosterzelle darauf wartet, dass Irina sich die Haare schneiden lässt, hört er den Romanovs die Berichte von Semyon Godunov zu, die mit der Absage des St. George's Day unzufrieden sind. gegen Vasily Shuisky, einen listigen und unzuverlässigen Diener, der jedoch von seiner Stärke überzeugt ist, will er niemanden bestrafen. Irina erscheint, und Boris, der sie an seine Schwankungen auf dem Weg zur Macht erinnert, bittet ihn zu rechtfertigen und zuzugeben, dass das Wohlergehen Russlands die Unwahrheit wert ist, durch die er König wurde. Irina, die sein Königreich billigt, fordert, dass er seine Schuld nicht vergisst und sich selbst nicht vergibt. Mit ihren eigenen verlassen, trennen sie sich.
Im Palast hören die Kinder von Boris, Fjodor und Xenia die Geschichten von Christian, dem dänischen Herzog, Xenias Verlobten - über eine harte Kindheit, über die Rückkehr zum Hof, über Kämpfe in Flandern mit den spanischen Truppen, aber als Fedor sich über seine Untätigkeit beschwert, bemerkt Christian das Seine Position, die es ihm ermöglicht, Herrschaft unter einem weisen Souverän zu studieren, ist viel würdiger. Christian erzählt, wie er Ksenia nach den Geschichten von Botschaftern, Kaufleuten und Gefangenen liebte, die zusammen mit der Größe Russlands die Schönheit, Intelligenz und Sanftmut der Prinzessin verherrlichten. Sie fangen an, über Boris zu sprechen, und alle stimmen der Liebe zum Zaren zu, der sich für den Ruhm und das Wohlergehen des Staates vergisst. Alle drei schwören, sich gegenseitig zu helfen. Christian bittet Boris, der im Kriegsfall eintrat, die Führung russischer Truppen zuzulassen, doch der Zar wird durch den seit vielen Jahren bestehenden Frieden entmutigt. Die Kinder gehen und Semyon Godunov, der gekommen ist, verkündet ein Gerücht über den wunderbar geretteten Prinzen Dimitri. In ihren Gemächern fragt Zarin Maria Grigorjewna den Angestellten Vlasyev nach dem Christentum und findet heraus, dass der König nicht sein Vater war und sein älterer Bruder, der jetzt regiert, ihn nicht mag, egal wie Julia Vlasyev ist. Da sie dem Angestellten kein Versprechen gibt, Boris auszusagen, ruft sie Dementyevna an und erfährt mit wachsender Verärgerung, dass Ksenia mit ihrem Bruder und Bräutigam zusammensaß, und der Zar begrüßt neue Bräuche. Die Zarin, die nach Wolochow kam, beschwert sich, dass Boris Ksenia für die Deutschen gepackt habe, ohne sie zu fragen, und die Deutschen hätten anscheinend die Prinzessin angemacht. Wolokhov verpflichtet sich, die Stärke des Christen zu erraten und zu zerschlagen („Es gibt eine solche Wurzel“). Im Wald, im Räuberlager, akzeptiert Ataman Khlopko eine neue Wiederauffüllung der Bauern, verflucht Boris und die Abschaffung des St. George's Day. Es erscheint ein Posadsky, der ohne Angst verlangt, seine von einem Räuberwächter auf der Moskauer Straße gefangenen Gefährten zu befreien, und über die wahren Neuigkeiten über das Erscheinen von Zarewitsch Dimitri berichtet. Posadsky schlägt Khlop zusammen, um nach Brjansk zu gehen, und dort, nachdem er die Truppen des Zarewitsch belästigt hat, erhält er Vergebung und kämpft gegen Godunow. Mitka erscheint und schleppt zwei außer Kontrolle geratene Mönche, Mikhail Povadin und Grishka Otrepyev, die darum bitten, sich der Baumwollarmee anzuschließen. Als Posadsky, der die Räuber durch Kämpfe mit Mitka amüsiert und befohlen hat, Weinfässer auszurollen, plötzlich verschwindet, stellt sich heraus, dass die Mönche, die mit ihm gingen, nicht wissen, wer er ist.
Boris muss zugeben, dass ihn das Auftauchen eines neuen Feindes auf einen blutigen Weg gebracht hat. Semyon Godunov, der herausfinden soll, wer sich hinter dem Namen Demetrius versteckt, sagt, er wisse nichts auf Kosten der Folter. Sie suchen den Namen von Grishka Otrepyev, einem flüchtigen Wundermönch, um den Feind irgendwie umzubenennen. Boris befiehlt, die Spione zu vermehren und Beweise für die Romanows zu finden und außerdem wegen des anhaltenden Hungers die Schatzkammer an das Volk zu verteilen und ihm zu befehlen, nicht auf die Fabeln über den Prinzen zu hören. Zarewitsch Fedor bittet ihn, ihn zu den Truppen zu schicken. Zarewna Ksenia trauert um Boris und seine Grausamkeit. Ein Christ fragt, ob Boris sich des Todes des Zarewitsch sicher ist, und erzählt Gerüchte nach. Die Kinder gehen, erscheint die Königin, voller Kaustizität und Verärgerung über den Christen und dolmetschen mit den Kindern über den "König". Der König bleibt taub gegenüber ihrer Forderung, den Christen wegzuschicken. Semyon Godunov berichtet über den raschen Vormarsch der Verräter, über den Transfer von Truppen zu ihnen und über den hartnäckigen Widerstand von Basmanov. Vasily Shuisky lädt Boris ein, selbst zu den Truppen zu gehen oder die Witwenkönigin zu schicken, um den Tod seines Sohnes zu bezeugen. Nachdem Boris Shuisky befohlen hat, Sprachen an diejenigen zu reißen, die Gerüchte verbreiten, schickt er Dimitry für seine Mutter. Im Haus von Fedor Nikitich Romanov trinken die Bojaren Romanovs, Sitsky, Repnin und Cherkassky für den Prinzen. Shuisky kommt an, berichtet über Boris 'Befehl, wird über seine Suche in Uglich befragt, er antwortet vage. Semyon Godunov mit Bogenschützen, der das Publikum beschuldigt hat, den Souverän mit Gift vergiftet zu haben, nimmt alle in Gewahrsam und rüstet Vasily Shuisky aus, um ein Verhör durchzuführen. Boris, der allein über eine erfüllte Vorhersage nachdachte („Getötet, aber lebendig“) und nach Shuisky kam, befahl, von der Front zu erklären, dass er selbst die Leiche des Zaren in Uglitsch gesehen hatte. Währenddessen drängen Berater auf Christian und erklären, dass er sich weigern sollte, Xenia zu heiraten, dass Boris sich mit Angst verraten hat, dass Ksenia die Tochter eines Bösewichts und eines Dieners ist. Christian, der die nahende Benommenheit spürt und an Boris 'Schuld glaubt, weiß nicht, worüber er sich entscheiden soll. Ksenia kommt, und er spricht verwirrt in Worten und Gedanken von der unvermeidlichen Trennung und ruft sie dann auf, vor dem Mördervater vor ihm wegzulaufen. Fjodor, der leise eingetreten ist, tritt für seinen Vater ein, sie werden kämpfen, Ksenia erinnert sich weinend an den Eid, den sie einander geleistet haben. Christian schwärmt und Ksenia und Fedor führen ihn weg, weil sie ihn für krank halten.
Auf dem Roten Platz hören Detektive Gespräche zwischen Menschen, die vom Requiem für Zarewitsch Dimitri gehen (das Anathema von Grischka wurde an derselben Stelle verkündet). Detektive provozieren und interpretieren Sprache auf eine für sie geeignete Weise und greifen fast jeden in einer Reihe. Vasily Shuisky vom Hinrichtungsort hält eine zweideutige Rede über den vorrückenden Feind und spricht über die Suche in Uglich, so dass unklar bleibt, wer das ermordete Kind war. Ungefähr um diese Zeit beschließt die Mutter des Prinzen, die aus dem Kloster gebracht wurde, jetzt die Nonne Martha, die auf Boris wartet und Rache will, den Betrüger als Sohn anzuerkennen. Sie sagt, dass sie ihren toten Sohn nicht gesehen hat, Gefühle verloren hat und beim Requiem Tränen über ihre Augen traten. Nachdem er nun von den Zeichen des Zarewitsch gehört hat, gibt er zu, auf wundersame Weise gerettet und lebendig geworden zu sein. Tsaritsa Maria Grigoryevna, die Täuschung verurteilen will, stellt Wolokow vor. Die Trauer, die Martha beim Anblick des Mörders ihres Sohnes ergriff, verrät sie, aber sie weigert sich, den Tod von Demetrius öffentlich zuzugeben. Bald berichtet der Arzt Boris über die Verschlechterung von Christians Gesundheit und über seine Ohnmacht. Semyon Godunov bringt einen Brief von Dimitry Ioannovich mit, in dem Boris am meisten von der versprochenen Barmherzigkeit im Falle einer freiwilligen Abdankung des Throns und damit vom Vertrauen des Diebes in die allgemeine Unterstützung bedrückt ist. Boris verlangt, einen kurzhaarigen Kleshnin mitzubringen, um sich des Todes des Prinzen sicher zu sein. Er heißt Christian und informiert Xenia und Fedor bald über seinen Tod.
Zwei Wachposten, die einen Nachtwächter in der Thronkammer tragen, verstecken sich vor Angst, als der schlaflose Boris auftaucht. Jemand stellt sich das Bild eines Menschen auf dem Thron vor und schickt die Wachposten, um zu überprüfen, wer dort sitzt. Semyon Godunov bringt Kleshnin, der den Tod von Demetrius bestätigt, erinnert, dass die von den Magiern vorhergesagte Amtszeit von Borisov zu Ende geht, und lädt ihn ein, Buße zu tun und ins Kloster zu gehen. Am Morgen, nachdem Boris Informationen von Basmanov erhalten hatte, der über den teilweisen Sieg über den „Dieb“ ankam, erzählt er Fedor von der Notwendigkeit, den Thron zu heiraten, und von dem Eid, zu dem die Bojaren gebracht werden. Fedor verlässt den Thron, denn er ist sich nicht sicher, ob der „Dieb“ nicht Demetrius ist. Boris bietet Fedor bedeutungsvoll an, die unbestreitbaren Beweise für den Tod des Zarewitsch vorzulegen, und nachdem er das Verbrechen seines Vaters verstanden hat, lehnt er entsetzt Beweise ab und erklärt, dass er die Krone annehmen wird. Im Speisesaal warten die Bojaren auf Basmanov und den König und verfluchen beide und tauschen Nachrichten über den "Prinzen" aus. Basmanov kommt herein und beschwert sich über seine unangemessene Exkommunikation. Boris erscheint mit den Kindern. Boris belohnt Basmanov. Die Bojaren bemerken die Traurigkeit von Xenia, bemitleiden sie und fragen sich, was sie mit ihr machen sollen, "wenn er ins Königreich kommt". Boris fordert Fedor einen Treueid und die Zustimmung zu diesem Eid in der Kathedrale, verliert an Kraft und fällt. Mit allgemeiner Verwirrung erklärt er, dass die Ursache seines Todes nicht Gift ist, sondern Trauer, die er den Bojaren hinterlässt, um einen Eid zu leisten, erinnert sich, dass „nur das Böse aus dem Bösen geboren wird“, und erklärt Fedor als König